The Fugs New Yorkban alakult 1964 végén az író Ed Sanders és Tuli Kupferberg által, Ken Weaverel a doboknál. Nem sokkal később Peter Stampfel és Steve Weber is csatlakozott hozzájuk a Holy Modal Roundersből. Kupferberg eufémizmusból a "fuck" szóból alkotta Norman Mailer novellája, a „The Naked and the Dead” alapján.
Az együttes alapító tagjaihoz, Ed Sandershez, Tuli Kupferberghez, és Ken Weaverhöz, többen csatolakoztak a ’60-as években más bandákból, néhányan session zenészek voltak, néhányan pedig más bandákból érkeztek. Ezek közé tartozott Weber és Stampfel, a basszusgitáros John Anderson, a gitáros Vinny Leary, Peter Kearney, a billentyűs Lee Crabtree, a gitáros Jon Kalb, Stefan Grossman, énekes/gitáros Jake Jacobs, Eric Gale, basszusgitáros Chuck Rainey, billentyűs Robert Banks, basszusgiáros Charles Larkey, billentyűs Ken Pine, gitáros Danny Kortchmar, klarinétos Perry Robinson, és a dobos Bill Wolf.
Az elmúlt 25 év folyamán az összeállításban az énekes¬/író Sanders és Kupferberg, a komponista/dalszövegíró/gitáros, Steven Taylor aki Allen Ginsbergel hosszú ideig együtt dolgozott, énekes/dalszövegíró és ütőhangszeres Coby Batty, és Scott Petito, aki zenész és zenei producer.
A politikailag felajzott, szatirikus, és ön-ironikus rock banda számos háború ellenes megmozduláson részt vett, a Vietnámi háború ellen, és a 80-as években az USA által indított harcok elleni megmozdulásokon is. Az együttes gyakran őszinte, és mindig vicces dalszövegei a szexről, a drogokról, és a politikáról gyakran váltott ki ellenséges reakciókat Amerika számos régiójában.
A szerepük a Vietnámi háború elleni tüntetésekben az 1960-as évek végén, ami során folyamatosan megpróbálták megkörnyékezni, és el hitelteleníteni a Pentagont Norman Mailer regényében, az „Armies of the Night” lapjain is megtalálható.
A „The Fugs” elkötelezett maradt az irodalomhoz, és a költőiséghez nagyon jó szocio-politikai érzéssel meghintve, és gyakran ástak bele az Európai, és Amerikai irodalomba inspirációért. Egyik ismertebb adaptációjuk Matthew Arnold „Dover Beach” című verse, illetve William Blake versei: Ah! Sun-flower and How Sweet I Roam'd.
Miután szóló projektekbe kezdtek az évek során Sanders and Kupferberg úgy döntött, hogy újra összeállítják a bandát, és az újraalakult „The Fugs számos koncertet adott. 1988. augusztust 15-én a Byrdcliff Barnban Woodstockban a Fugs előadta az egyik első „újraalakult” koncertjüket. A csapat ezen feltámadása számos alkalommal megtörtént az elkövetkező időszakokban Steve Tayloral, Coby Battyvel, a basszusgitáros Mark Kramerel, a gitáros Vinny Learyvel (aki részt vett a csapat első két lemezének elkészítésében), és a basszusgitástos/billenytűs Scott Petitoval. Az újraalakult Fugs számos koncertet adott Amerika különböző pontjain, és Európában az elkövetkező években.
1994 során a csapat szeretett volna Woodstockban számos koncertet adni, (ahol Sanders sokáig élt) hogy emléket állítsanak az 1969-es Woodstock Fesztiválnak, ami Bethel városátol alig 50 mérföldre helyezkedett el. Megtudták, hogy egy csapat befektető azt tervezte, hogy újra megszervezi a Woodstock fesztivált 1994 augusztusában alig 8 mérföldre az eredeti helyszíntől Saugertiesben. Ez a fesztivál sokkal erősebben lett volna kontrollálva, és sokkal jobban menedzselve, mint az eredeti. A „The Fugs” eldöntötte, hogy megrendezi a saját 1994 augusztusi koncertjét "The Real Woodstock Festival" címmel, olyan szellemiségben ami nagyon hasít az eredetihez, és megtartja ugyanazt az atmoszférát. Az eredeti névsor Fugs névsor: Sanders, Kupferberg, Taylor, Batty, és Petito számos koncert alkalmával játszottak együtt, és csatlakozott hozzájuk a vokalista Amy Fradon és Leslie Ritter, illetve még feltűnt Allen Ginsberg és Country Joe McDonald. 2003-ban a csapat kiadta albumát „The Fugs Final CD (Part 1)” címmel ami pozitív kritikákat kapott. 2004 során a The Fugs elkezdte utolsó lemezük felvételeit Be Free: The Fugs Final CD (Part 2) címmel.
2008-ban egyik daluk a "CIA Man"szerepelt egy filmben „Burn After Reading” amit a Coen fivérek készítettek . 2009-ben, Kupferberg két stroke-t szenvedett el, amiből az utóbbi látását is károsította. Folyamatos orvosi ellátásban részesült, de képes volt befejezni a munkálatokat a „Be Free” című számukon, amit New Yorki lakásában vettek fel. Egy jótékonysági koncertet tartottak Kupfenbergnek Brooklynban, 2010 februárjában, ahol minden egykori Fugs tag fellépet -Kupferbergen kívül-, mint Lou Reed, Sonic Youth, Patti Smith Group, Lenny Kaye, és sokan mások. A „Be Free: The Fugs Final CD (Part 2)” 2010 February 23-án lett kiadva. A Borító egy csigát ábrázol, amin Allen Ginsberg verse a Howl található és Ed Sanders rendezte. Az album producere Steve Taylor és Ed Sanders.
Kupferberg 2010. július 12-én halt meg Manhattanben, 86 évesen. 2008-ban az egyik utolsó interjúban, amit adott, ezt mondta a Mojo Magazinnak: "Aki az ’50-es években élt senki sem hitte, hogy a ’60-as évek léteztek. Szóval mindig van remény”.
